Das ISB macht die Erkenntnisse der Forschung und die Erfahrungen der Praxis für die Schule nutzbar. Es unterstützt und berät das Staatsministerium bei der Weiterentwicklung des gegliederten bayerischen Schulwesens. Die Arbeit des ISB kommt allen Schularten zugute.

Das Staatsinstitut

• fördert die pädagogische, didaktische und methodische Arbeit der Schulen
• entwickelt die Lehrpläne aller Schularten
• arbeitet an der Erstellung von zentralen Prüfungsaufgaben und Tests mit
• unterstützt die innere Schulentwicklung
• erfasst fortlaufend Daten und Befunde zum bayerischen Schulwesen und gibt durch ein flächendeckendes Bildungsmonitoring Empfehlungen zur Qualitätssicherung der bayerischen Schulen
• regt Schulversuche an, begleitet sie und wertet sie aus
• macht Erkenntnisse und Inhalte der Medienpädagogik und Mediendidaktik sowie der Informations- und Kommunikationstechnik für die Schule nutzbar
• wirkt bei der Lehrerfortbildung mit und arbeitet mit den Einrichtungen der Lehrerfortbildung zusammen

Die Gliederung in vier Schulabteilungen folgt der Struktur des gegliederten bayerischen Schulwesens. Die Grundsatzabteilung und die Qualitätsagentur arbeiten schulartübergreifend. Im Direktorat sind zentrale Aufgaben angesiedelt.
In den Schulabteilungen arbeiten besonders qualifizierte Lehrerinnen und Lehrer der jeweiligen Schulart. In den beiden neu eingerichteten Abteilungen "Qualitätsagentur" und "Grundsatzabteilung" sind neben Lehrkräften verschiedener Schularten u. a. Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter aus den Bereichen Erziehungswissenschaften, Psychologie, Soziologie und Sozialgeographie sowie aus der Datenverarbeitung tätig.